全國政協委員賈康在《關于加快環境保護稅立法》的提案中建議：

一是順應總體財稅改革方向和部署加快立法、及早開征環境保護稅。在穩定宏觀稅負的前提下開征環境保護稅，可在環境費改稅、改革資源稅的同時，相應減少企業所得稅、關稅等稅負。同時，建議環境保護稅全部進入地方稅收入，作為一般預算收入統籌管理，不延續“?？顚Ｓ?rdquo;的老路。為了解決基層環保官員靠排污費發工資的情況，從編制和預算上向基層環保部門適當傾斜以“收支兩條線”規范強化基層環保監管。

       二是適當提高環境保護稅稅率并縮小免征范圍。可以參照一些省市已自行調高的環境費率作優化設計，如北京市二氧化硫、氮氧化物、化學需氧量排污費水平均已提高到每千克10元，遠高于征求意見稿中每千克1.26元、1.26元和1.4元的水平。據測算，我國電廠脫硫脫硝成本分別為每千克2元和5元，均高于征求意見稿中每千克1.26元的水平。如果不調高征收標準，開征環境保護稅對減排的促進作用會大打折扣。此外，不建議對非規模化養殖的農業、達標的城鎮污水處理廠和生活垃圾處理廠免征環境保護稅。2013年，城市污水排放占我國廢水排放總量的近七成；2014年到2020年預計我國城鎮生活垃圾將新增3162萬噸；2014年農業貢獻的化學需氧量和氨氮排放占到了總量的48%和32%。這三類污染源從絕對量和相對量上都非常可觀，建議取消與其相關的免征規定。

三是設計清晰的部門協調分工。在已有征求意見稿基礎上，進一步細化征收管理流程，明確納稅單位、稅負和環保部門的責任義務?？蓞⒖辑h保部門現已擁有的排污申報及核定數據作為核定環境保護稅應納稅額的基礎數據，避免不必要的重復工作給企業和政府部門帶來過多額外負擔。今后由企業向環保部門申報污染物、環保部門審核污染物排放數據、企業根據審核后的排污數據向稅務部門申報環境保護稅、由稅務部門征收，同時各部門實現信息共享，緊密合作。